「俺は水槽で孤独になった」
主人公・クロは、ファントラ水族館の巨大水槽で泳ぐ“クロマグロ”。
たくさんの仲間に囲まれ、大好きな飼育員さんを毎日眺めて幸せな日々を送っていた。だが――
……突然、大切な日々は一瞬にして泡となって消えてしまう。
急に目の前が暗くなり、意識を奪われるクロ。
時を同じくして、クロの仲間たちも次々と苦しみ出し、水槽から姿を消していく。
その不可解なトラゴイディアは誰も止めることが出来ず、クロが目を覚ましたときには……水槽のマグロはクロ一匹だけになっていた。
巨大水槽で一体何が起こったのか。
クロは他の種族の仲間たちの力を借りて、事件の解明へと奔走し始める――。